I found this and it's interesting!
Code bioFOX aims at implementing various bioinformatics tools as an extension on Firefox. Analysis of your favorite gene(s) usually require(s) retrieving it from a database like NCBI or Swiss-Prot and then performing one or more tasks including translation, blast search, property analysis like codon usage, molecular weight calculation etc. bioFOX is available as a sidebar only for Firefox and can be activated by pressing Ctrl-shift-F after installation.
http://biofox.mozdev.org/installation.html
http://schematron.unl.edu/biofox/features.html
bioFox Firefox Toolbar
- Ethel
- Venus Project Founder
- Posts: 2395
- Joined: Fri Mar 19, 2004 10:41 am
- Academic status: Alumnus/a
- Gender: ♀
- Location: New York City, NY
- Contact:
bioFox Firefox Toolbar
There's no place like 127.0.0.1
- HdkiLLeR
- Venus Project Founder
- Posts: 4356
- Joined: Tue Jan 27, 2004 4:41 pm
- Academic status: Alumnus/a
- Gender: ♂
- Location: New York, NY
- Contact:
For debian/{k}ubuntu users try apt-get install mozilla-biofox
-----BEGIN GEEK CODE BLOCK-----
Version: 3.12
GCS d-->--- s+:+ a- C++(+++) BILS++++$ P--- L++++>+++++ E--- W+++ N+ o+ K w--
O M+ V-- PS++>+++ PE- Y++ PGP++ t+ 5+ X+ R* tv b++ DI- D+ G+++ e+++>++++ h r++ y++
------END GEEK CODE BLOCK------
"UNIX is basically a simple operating system, but you have to be a genius to understand the simplicity." -- Dennis Ritchie
Version: 3.12
GCS d-->--- s+:+ a- C++(+++) BILS++++$ P--- L++++>+++++ E--- W+++ N+ o+ K w--
O M+ V-- PS++>+++ PE- Y++ PGP++ t+ 5+ X+ R* tv b++ DI- D+ G+++ e+++>++++ h r++ y++
------END GEEK CODE BLOCK------
"UNIX is basically a simple operating system, but you have to be a genius to understand the simplicity." -- Dennis Ritchie
- lumenintervalum
- Wow! Terabyte level
- Posts: 2377
- Joined: Thu May 06, 2004 7:06 pm
- Location: somewhere far beyond..
- Contact:
υπάρχει και τέτοιο πράγμα?!? εντυπωσιακό και χρήσιμο -για σας τουλάχιστον!!
We are just a moment in time
A blink of an eye
A dream for the blind
Visions from a dying brain
I hope you don't understand
_______________________
scraps& photo gallery στο deviantart- last update 25/08/06
A blink of an eye
A dream for the blind
Visions from a dying brain
I hope you don't understand
_______________________
scraps& photo gallery στο deviantart- last update 25/08/06
- Ethel
- Venus Project Founder
- Posts: 2395
- Joined: Fri Mar 19, 2004 10:41 am
- Academic status: Alumnus/a
- Gender: ♀
- Location: New York City, NY
- Contact:
χιχι.... δεν ξέρω πολλά ακόμα!
ψάχνοντας βρήκα πως αν ανοίξεις ένα workspace και γράψεις μέσα μια ακολουθία DNA (πχ. ATGGGCTAAAACGTCG) τότε μπορείς στο μενού Nucleotide να τη μεταφράσεις (δήlαδή να βρεις πρωτείνες που παράγονται από αυτή), να βρεις την συμπληρωματική της και την ανάποδη(δηλaδή απ΄το τέλος στην αρχή). Επίσης στο τελευταίο το Codon usage μπορείς να δεις σε τι ποσοστό περιέχονται μέσα στην ακολουθία σου τα κωδικόνια ή τριπλέτες (δηλ. τα UUA, AAT, CGA κλπ) και ποιά είναι αυτά.
Τα παρακάτω δεν είχα χρόνο να τα κοιτάξω και είμαι άσχετη ακόμα!
ψάχνοντας βρήκα πως αν ανοίξεις ένα workspace και γράψεις μέσα μια ακολουθία DNA (πχ. ATGGGCTAAAACGTCG) τότε μπορείς στο μενού Nucleotide να τη μεταφράσεις (δήlαδή να βρεις πρωτείνες που παράγονται από αυτή), να βρεις την συμπληρωματική της και την ανάποδη(δηλaδή απ΄το τέλος στην αρχή). Επίσης στο τελευταίο το Codon usage μπορείς να δεις σε τι ποσοστό περιέχονται μέσα στην ακολουθία σου τα κωδικόνια ή τριπλέτες (δηλ. τα UUA, AAT, CGA κλπ) και ποιά είναι αυτά.
Τα παρακάτω δεν είχα χρόνο να τα κοιτάξω και είμαι άσχετη ακόμα!
There's no place like 127.0.0.1