Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Εδώ μπορείτε να ενημερώνετε ή να ενημερώνεστε για τη διοργάνωση διαφόρων συνεδρίων και σεμιναρίων.
Post Reply
?:=2b|~2b
Kilobyte level
Kilobyte level
Posts: 164
Joined: Wed Dec 10, 2008 9:17 pm
Academic status: Professor
Gender:

Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by ?:=2b|~2b » Thu Apr 15, 2010 11:08 am

Στο πλαίσια της Σειράς Σεμιναρίων του Τμήματος μας, θα διεξαχθεί την Τετάρτη 28/4 στις 1.00μμ ομιλία του Σεραφείμ Μπατζόγλου, καθηγητή του Τμήματος Πληροφορικής του πανεπιστημίου Stanford, με τίτλο:

Extracting medical and ancestry information from genomes.

περίληψη:
Obtaining DNA information is rapidly becoming inexpensive enough so that every individual may soon be genotyped or even sequenced. In this talk, I will talk about two main applications of personal genomics: the study of complex diseases, and the inference of population ancestry.

First, I will talk about how to compare genomes across patients and healthy individuals to study disease similarity. The idea is that many complex diseases such as diabetes, rheumatoid arthritis, hypertension or bipolar disorder, are partially caused by similar genes. Moreover, gene versions (alleles) that protect from one disease may increase the risk of another, pointing to competing biological mechanisms causing different diseases.

Second, I will talk about how given an individual's genome, or genotype (a low-resolution sample of a genome), we can infer the populations of the individual's ancestors up to 10 or even 20 generations back.

σύντομο βιογραφικό σημείωμα:
Serafim is an Associate Professor of Computer Science at Stanford University. He received his PhD in Compurer Science from MIT in 2000. He is the recipient of the Sloan Fellowship, and was named one of the top 100 young innovators in 2003 by the Technology Review magazine. His research focuses on computational methods for DNA whole-genome assembly, comparative genomics, and population genetics.

---
Η ομιλία θα διεξαχθεί στην αίθουσα Α41 (Πατησίων 76 Πτέρυγα Αντωνιάδου, 4ος όροφος).

ιστότοπος: http://grad59.cs.aueb.gr/lectures/
User avatar
dexter
Venus Former Team Member
Posts: 2496
Joined: Wed Jan 09, 2008 11:50 pm
Academic status: N>4
Gender:
Location: springfield
Contact:

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by dexter » Thu Apr 15, 2010 11:10 am

πολύ ενδιαφέρον..
ευχαριστούμε για την ενημέρωση :smt023
http://foss.aueb.gr
always aim for for the sky for if you fail you can at least reach the clouds..
ALL BLACKS supporter..
http://www.bringthemback.org/
User avatar
Loner
Venus Former Team Member
Posts: 4004
Joined: Fri Oct 26, 2007 11:08 pm
Academic status: N>4
Gender:
Location: Στη ρωγμή του χρόνου

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by Loner » Thu Apr 15, 2010 11:25 am

will be there! :)
You either die a Spongebob or live long enough to see yourself become the Squidward.
User avatar
Serendipity
Gbyte level
Gbyte level
Posts: 1977
Joined: Tue Sep 19, 2006 11:16 pm
Academic status: Alumnus/a
Gender:
Location: Sweden
Contact:

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by Serendipity » Thu Apr 15, 2010 11:35 am

ακουγεται τρομερο!! i'll be there too!!
-Two things are infinite: the universe and human stupidity; and I'm not sure about the universe.
--Albert Einstein--


ImageImage

My new blog Serendipity's thoughts!
User avatar
sandra
Wow! Terabyte level
Wow! Terabyte level
Posts: 4917
Joined: Mon Oct 02, 2006 11:37 am
Academic status: Alumnus/a
Gender:
Location: στη φωλιά μου κοιτώντας ένα χωράφι με στάρι...

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by sandra » Thu Apr 15, 2010 12:33 pm

Πρέπει να σας δώσουμε τα προγράμματα μας για να κανονίζετε τις ομιλίες στα κενά μας. Έχω μάθημα εκείνη την ώρα αλλά ψήνομαι πολύ να παρακολουθήσω.
Από εδώ κι εμπρός θα είσαι για πάντα υπεύθυνος για εκείνο που έχεις ημερώσει.
Είσαι υπεύθυνος για το τριαντάφυλλο σου...
User avatar
Zifnab
Venus Former Team Member
Posts: 7581
Joined: Tue Nov 15, 2005 2:42 am
Academic status: MSc
Gender:
Location: Connecticut
Contact:

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by Zifnab » Thu Apr 15, 2010 12:52 pm

I will definitely be there :-D
User avatar
nikolas17
Gbyte level
Gbyte level
Posts: 1117
Joined: Sun Sep 20, 2009 12:51 am
Academic status: N>4
Gender:
Location: 192.168.1.1

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by nikolas17 » Thu Apr 15, 2010 2:45 pm

Πολύ ενδιαφέρον ακούγεται! :smt023

Μιας και δεν έχω μάθημα θα περάσω να παρακολουθήσω και 'γω :)
Image
User avatar
stoupeace
Wow! Terabyte level
Wow! Terabyte level
Posts: 5372
Joined: Tue Aug 26, 2008 4:08 pm
Academic status: High school
Gender:

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by stoupeace » Thu Apr 15, 2010 2:53 pm

Οχι οτι λεω οτι δεν εχει λογο υπαρξης η ομιλία, απλά δεν καταλαβαίνω τη σύνδεσή της με την Πληροφορική. Εκτός αν δε μιλήσει τόσο για τα Ιατρικά και προτείνει αλγοριθμους για την εξέταση των χρωμοσωμάτων και την εξαγωγη πληροφοριων απο αυτά
Η καλύτερη μπάντα όλου του κόσμου: Sonata Antartika
Mpomp is building an army army. And I got my head back.
░░░░░███████ ]▄▄▄▄▄▄▄▄
▂▄▅█████████▅▄▃▂ ____☻/︻╦╤─
Il███████████████████]. /▌
_◥⊙▲⊙▲⊙▲⊙▲⊙▲⊙▲⊙◤.. . / \
User avatar
Zifnab
Venus Former Team Member
Posts: 7581
Joined: Tue Nov 15, 2005 2:42 am
Academic status: MSc
Gender:
Location: Connecticut
Contact:

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by Zifnab » Thu Apr 15, 2010 3:24 pm

Stoupeace wrote:Οχι οτι λεω οτι δεν εχει λογο υπαρξης η ομιλία, απλά δεν καταλαβαίνω τη σύνδεσή της με την Πληροφορική. Εκτός αν δε μιλήσει τόσο για τα Ιατρικά και προτείνει αλγοριθμους για την εξέταση των χρωμοσωμάτων και την εξαγωγη πληροφοριων απο αυτά
Βιοπληροφορική btw???
Προφανώς και έχει σύνδεση με την πληροφορική - τα πάντα έχουν και βοηθούνται από αυτήν. Εξάλλου σαν "πανεπιστήμονες" πρέπει να είμαστε ανοικτοί να συνεργαστούμε με την οποιαδήποτε επιστήμη - πόσο μάλλον με την βιολογία που εξετάζει το ανθρώπινο γονιδίωμα :smt023
Εκεί που λέει για genome extraction ίσως μιλήσει για ανάκτηση πληροφορίας υπό μία έννοια - πάμε και βλέπουμε :cool:
User avatar
stoupeace
Wow! Terabyte level
Wow! Terabyte level
Posts: 5372
Joined: Tue Aug 26, 2008 4:08 pm
Academic status: High school
Gender:

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by stoupeace » Thu Apr 15, 2010 3:38 pm

Zifnab wrote:Βιοπληροφορική btw???
Προφανώς και έχει σύνδεση με την πληροφορική - τα πάντα έχουν και βοηθούνται από αυτήν. Εξάλλου σαν "πανεπιστήμονες" πρέπει να είμαστε ανοικτοί να συνεργαστούμε με την οποιαδήποτε επιστήμη - πόσο μάλλον με την βιολογία που εξετάζει το ανθρώπινο γονιδίωμα :smt023
Εκεί που λέει για genome extraction ίσως μιλήσει για ανάκτηση πληροφορίας υπό μία έννοια - πάμε και βλέπουμε :cool:
Σιγουρα, δεν ειπα οτι δεν εχει νοημα η ομιλια, ισα ισα! Και συμφωνώ με όσα λες.
Εκει που ηθελα να καταληξω ειναι η απορία που είχα απο την αρχή, μήπως χρειάζεται ένα χ ιατρικό υπόβαθρο, παραπάνω απο House ή Grey's Anatomy?
Η καλύτερη μπάντα όλου του κόσμου: Sonata Antartika
Mpomp is building an army army. And I got my head back.
░░░░░███████ ]▄▄▄▄▄▄▄▄
▂▄▅█████████▅▄▃▂ ____☻/︻╦╤─
Il███████████████████]. /▌
_◥⊙▲⊙▲⊙▲⊙▲⊙▲⊙▲⊙◤.. . / \
User avatar
Serendipity
Gbyte level
Gbyte level
Posts: 1977
Joined: Tue Sep 19, 2006 11:16 pm
Academic status: Alumnus/a
Gender:
Location: Sweden
Contact:

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by Serendipity » Thu Apr 15, 2010 4:25 pm

νταξει αν ήσουν απο θετική πιστευω θα έχεις μια γενική ιδέα για τη δομη του dna. Δεν πιστευω οτι θα ειναι κατι τόσο περίπλοκο...
-Two things are infinite: the universe and human stupidity; and I'm not sure about the universe.
--Albert Einstein--


ImageImage

My new blog Serendipity's thoughts!
User avatar
enum21
Venus Former Team Member
Posts: 5436
Joined: Mon Feb 16, 2009 9:06 pm
Academic status: Alumnus/a
Gender:
Location: Underworld

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by enum21 » Thu Apr 15, 2010 4:56 pm

Πάρα πολύ ενδιαφέρον!!!!!! :-D

yeah will be there too!!

thx for posting! :smt023
User avatar
AnINffected
Gbyte level
Gbyte level
Posts: 1935
Joined: Fri Jul 30, 2004 7:12 am
Location: There and Back Again

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by AnINffected » Thu Apr 15, 2010 8:28 pm

sandra wrote:Πρέπει να σας δώσουμε τα προγράμματα μας για να κανονίζετε τις ομιλίες στα κενά μας. Έχω μάθημα εκείνη την ώρα αλλά ψήνομαι πολύ να παρακολουθήσω.
Όχι, πρέπει να κανονίζετε τις ομιλίες 7-9μμ που δε δουλεύω :p
The Analytical Engine has no pretensions to originate anything. It can do whatever we know how to order it to perform (...)
Ada Lovelace


Θέλω και εγώ να παίξω D&D λέμε!!! :-( :-(
User avatar
sinty
Kilobyte level
Kilobyte level
Posts: 473
Joined: Thu Nov 06, 2008 2:07 pm
Academic status: MSc
Location: wondering...

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by sinty » Tue Apr 20, 2010 9:46 pm

Τέλειοοοοοοοοο!!!! :-D :-D :-D :-D :-D Βρε δε πα να 'χω μάθημα δεν το χάνω! enum επομίζεσαι την ευθύνη να μου το θυμισεις αν το ξεχασω???
She's lost in the darkness, fading away
I'm still around here, screaming her name
User avatar
enum21
Venus Former Team Member
Posts: 5436
Joined: Mon Feb 16, 2009 9:06 pm
Academic status: Alumnus/a
Gender:
Location: Underworld

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by enum21 » Tue Apr 27, 2010 4:02 pm

Extracting medical and ancestry information from genomes -ΑΚΥΡΏΘΗΚΕ!
Σεραφείμ Μπατζόγλου
28/04/2010 - 13:00
Αίθουσα Α41, Πτέρυγα Αντωνιάδου

Λόγω των γνωστών προβλημάτων στις αερομεταφορές από την ηφαιστειακή στάχτη της Ισλανδίας, η ομιλία δυστυχώς ακυρώθηκε.

Obtaining DNA information is rapidly becoming inexpensive enough so that every individual may soon be genotyped or even sequenced. In this talk, I will talk about two main applications of personal genomics: the study of complex diseases, and the inference of population ancestry.

First, I will talk about how to compare genomes across patients and healthy individuals to study disease similarity. The idea is that many complex diseases such as diabetes, rheumatoid arthritis, hypertension or bipolar disorder, are partially caused by similar genes. Moreover, gene versions (alleles) that protect from one disease may increase the risk of another, pointing to competing biological mechanisms causing different diseases.

Second, I will talk about how given an individual's genome, or genotype (a low-resolution sample of a genome), we can infer the populations of the individual's ancestors up to 10 or even 20 generations back.

Short Bio:

Serafim is an Associate Professor of Computer Science at Stanford University. He received his PhD in Compurer Science from MIT in 2000. He is the recipient of the Sloan Fellowship, and was named one of the top 100 young innovators in 2003 by the Technology Review magazine. His research focuses on computational methods for DNA whole-genome assembly, comparative genomics, and population genetics.
Δεν μπορώ καθόλου αύριο :smt010
Όσοι πάτε πείτε εντυπώσεις!! :)
User avatar
sandra
Wow! Terabyte level
Wow! Terabyte level
Posts: 4917
Joined: Mon Oct 02, 2006 11:37 am
Academic status: Alumnus/a
Gender:
Location: στη φωλιά μου κοιτώντας ένα χωράφι με στάρι...

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by sandra » Tue Apr 27, 2010 4:24 pm

Αφού λέει ότι ακυρώθηκε :smt017
Από εδώ κι εμπρός θα είσαι για πάντα υπεύθυνος για εκείνο που έχεις ημερώσει.
Είσαι υπεύθυνος για το τριαντάφυλλο σου...
User avatar
Zifnab
Venus Former Team Member
Posts: 7581
Joined: Tue Nov 15, 2005 2:42 am
Academic status: MSc
Gender:
Location: Connecticut
Contact:

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by Zifnab » Tue Apr 27, 2010 4:24 pm

ελα ντε :smt017
User avatar
enum21
Venus Former Team Member
Posts: 5436
Joined: Mon Feb 16, 2009 9:06 pm
Academic status: Alumnus/a
Gender:
Location: Underworld

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by enum21 » Tue Apr 27, 2010 4:27 pm

Μα άλλαξε την ημερομηνία σε 28/04 ...
Από εδώ το είδα
User avatar
Loner
Venus Former Team Member
Posts: 4004
Joined: Fri Oct 26, 2007 11:08 pm
Academic status: N>4
Gender:
Location: Στη ρωγμή του χρόνου

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by Loner » Tue Apr 27, 2010 4:28 pm

enum21 wrote:Μα άλλαξε την ημερομηνία σε 28/04 ...
Από εδώ το είδα
Χαχαχαχα δες στο πρώτο ποστ την ημερομηνία :lol:
You either die a Spongebob or live long enough to see yourself become the Squidward.
User avatar
enum21
Venus Former Team Member
Posts: 5436
Joined: Mon Feb 16, 2009 9:06 pm
Academic status: Alumnus/a
Gender:
Location: Underworld

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by enum21 » Tue Apr 27, 2010 4:30 pm

Loner wrote:
enum21 wrote:Μα άλλαξε την ημερομηνία σε 28/04 ...
Από εδώ το είδα
Χαχαχαχα δες στο πρώτο ποστ την ημερομηνία :lol:

:oops: :oops: :smt005 :smt005
καλά μιλάμε :smt021 :smt021

νόμιζα ότι ήταν να γίνει την προηγούμενη και ακυρώθηκε και θα γινόταν αύριο.. :smt021 :smt021

ό,τι να΄ναι! :smt021 :smt021 :-p
User avatar
dexter
Venus Former Team Member
Posts: 2496
Joined: Wed Jan 09, 2008 11:50 pm
Academic status: N>4
Gender:
Location: springfield
Contact:

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by dexter » Tue Apr 27, 2010 4:43 pm

δεν θα γίνει καθόλου?
κρίμα..
http://foss.aueb.gr
always aim for for the sky for if you fail you can at least reach the clouds..
ALL BLACKS supporter..
http://www.bringthemback.org/
User avatar
Zifnab
Venus Former Team Member
Posts: 7581
Joined: Tue Nov 15, 2005 2:42 am
Academic status: MSc
Gender:
Location: Connecticut
Contact:

Re: Σεμινάριο: Extracting medical and ancestry information from genomes.

Post by Zifnab » Tue Apr 27, 2010 4:44 pm

ίσως μεταφερθεί μερικούς μήνες μετά??? Μακάρι να μην ακυρωθεί πάντως
Post Reply

Return to “Συνέδρια - Σεμινάρια”